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返回 云计算,助力基因测序行业腾飞发展

2021-05-27

随着基因测序技术和测序市场的不断发展和成熟,基因测序对于普通百姓来讲也不再是一个完全陌生概念,应用领域从生育健康发展到遗传病诊断,再到肿瘤基因早筛和个人基因组测序。同时,测序市场规模近年来也呈现爆发式增长,据中商产业研究院推测,2022年中国基因测序行业市场规模将突破150亿元。

解密云计算与基因测序

在基因检测领域,对于采集的基因样本进行数据分析和处理需要大量的计算资源。以最普遍的二代测序技术举例,从测序原理可以知道,整个基因测序过程简单地理解就是先将基因样本打碎,然后重新拼接还原的过程。

由此,我们不难理解,基因测序工程动辄需要数万/数十万个基因测序及模型建立,需要多大的计算和存储资源。以国内某机构每天产生的数据量300T至600T计算。所以当前,海量的基因数据和测序分析工作,给传统的IT基础架构的建设、使用和运维等带来极大挑战和压力,总结如下:

1. 三代测序发展,算力要求高:新兴的三代测序借助读长优势,可以很好的覆盖二代测序的不足,已成为重要技术趋势,传统基础架构已经无法满足其对算力方面的更高要求。

2. 峰谷分配不均,需弹性缩扩资源:测序业务一般为项目型,存在峰谷之分,峰值资源需求较大,本地资源不足以支持,低谷时资源闲置浪费,需可伸缩的IT资源。

3. 海量传输数据,传输带宽要求高:基因测序行业每天几百G甚至十几个T的基因下机数据,海量数据的传输需求对用户数据交付是一个极大的挑战。

4. 系统环境复杂,运维难度高:基因测序行业PB级别数据存储包含规划、分配、回收、归档等过程,这些过程对数据管理员要求非常高,造成运维成本高。

5. 基因数据的安全性要求高:基因测序行业掌管着大量客户的隐私数据,甚至涉及到国家生物基因安全,数据安全保护重要性不言而喻。

如何让研究人员从IT基础设施的难题中解放出来并回归到基因组学研究上,已成为整个基因测序行业必须要突破的瓶颈。云计算给基因行业带来了全新的解决方案:通过灵活的扩展和方便的资源调度,可以让研究中心、科研部门以及临床应用变得方便快捷。企业可以在云端部署基因数据分析乃至整个医疗与健康管理的分析全流程,从而推动基因行业的发展和应用。

有孚专有云+对象存储

助力企业构建核心IT能力

作为国内知名的专有云服务平台,有孚专有云在成立之初就面向不同行业、不同场景下的业务需求,提供驻地化部署、混合云部署、多云互通管理等多种业务模式。在基因行业,有孚专有云充分发挥了多年来在高性能计算、海量存储、数据安全方面等优势,为基因行业客户提供了高度整合多种功能的基因行业专有云解决方案。

有孚专有云基因行业解决方案的核心是计算高性能与对象存储相结合,为客户提供高密度的计算能力和海量的存储空间,同时结合多年来在云计算市场的经验,形成了独具风格的有孚专有云基因行业解决方案:

01

高性能、稳定弹性计算

针对基因行业的计算资源不足,提供弹性云服务器,特别是针对原始下机测序数据解析和三代测序数据,提供专门的GPU云服务器等计算实例和裸金属服务器,匹配基因检测各流程中海量数据分析对计算资源的高性能需求。

02

数据存储及归档

针对基因行业存储资源的不足,提供了对象存储、文件分布式存储、块存储等多种数据存储方式,支持冷热数据分层管理,缓存模式下,自动根据数据的热度实现数据本地和云端的分层,支持云端多台ECS挂载OSS,满足海量数据存储需求,也支持数据分发、归档等多个场景。

03

数据分层转储存

根据访问频率划分为热数据、温数据及冷数据。影像热数据和温数据存储在有孚云存储中,通过SSD和HDD提供更高性能的访问速度影像;冷数据迁移到有孚蓝光云,解决医院对影像数据长期保存、数据备份的需求。

04

专业的数据中心托管服务

针对基因行业普遍缺少合规的服务器管理服务,缺乏服务器运维人员,有孚网络依托自身在北京、上海、深圳的高等级数据中心资源为基因行业提供合规、安全的服务器托管与运维服务。

05

数据传输及数据安全

如何将测序数据传到云端?有孚网络提供提供专网专线接入,专网两端以内网方式通讯,享受低延迟和高带宽,保证海量应用数据的稳定传输;同时,与公网完全隔绝,无数据泄露风险,实现高速、可靠和安全的数据传输。

未来前景

对于基因测序行业来说,逐步上“云”,成为数字生命时代势在必行的举措。所以基因测序企业在有孚专有云基因行业解决方案强有力支持下,腾“云”起航,第一时间获取降本增效的创新秘诀,才能在基因行业激烈的竞争中脱颖而出。同时,有孚网络作为国内知名的企业级云计算服务商,将为整个基因行业提供源源不断的动力,助力精准医疗的发展速度,用科技造福未来。